MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2082952610 · doi:10.1074/jbc.275.2.1079

Cloning, Localization, and Functional Expression of Sodium Channel β1A Subunits

2000· article· en· W2082952610 sur OpenAlexaff
Kristin A. Kazen-Gillespie, David S. Ragsdale, Michael R. D’Andrea, Laura N. Mattei, Kathryn E. Rogers, Lori L. Isom

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Research Resources
Mots-clésSodium channelBiologyMolecular biologyGene expressionMessenger RNACell biologyChemistryGeneSodiumBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Auxiliary beta1 subunits of voltage-gated sodium channels have been shown to be cell adhesion molecules of the Ig superfamily. Co-expression of alpha and beta1 subunits modulates channel gating as well as plasma membrane expression levels. We have cloned, sequenced, and expressed a splice variant of beta1, termed beta1A, that results from an apparent intron retention event. beta1 and beta1A are structurally homologous proteins with type I membrane topology; however, they contain little to no amino acid homology beyond the shared Ig loop region. beta1A mRNA expression is developmentally regulated in rat brain such that it is complementary to beta1. beta1A mRNA is expressed during embryonic development, and then its expression becomes undetectable after birth, concomitant with the onset of beta1 expression. In contrast, beta1A mRNA is expressed in adult adrenal gland and heart. Western blot analysis revealed beta1A protein expression in heart, skeletal muscle, and adrenal gland but not in adult brain or spinal cord. Immunocytochemical analysis of beta1A expression revealed selective expression in brain and spinal cord neurons, with high expression in heart and all dorsal root ganglia neurons. Co-expression of alphaIIA and beta1A subunits in Chinese hamster lung 1610 cells results in a 2.5-fold increase in sodium current density compared with cells expressing alphaIIA alone. This increase in current density reflected two effects of beta1A: 1) an increase in the proportion of cells expressing detectable sodium currents and 2) an increase in the level of functional sodium channels in expressing cells. [(3)H]Saxitoxin binding analysis revealed a 4-fold increase in B(max) with no change in K(D) in cells coexpressing alphaIIA and beta1A compared with cells expressing alphaIIA alone. beta1A-expressing cell lines also revealed subtle differences in sodium channel activation and inactivation. These effects of beta1A subunits on sodium channel function may be physiologically important events in the development of excitable cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations151
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetIon channel regulation and functionTravaux en français237 207