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Apparent absence ofoct 3/4 from the chicken genome

2000· article· en· W2082986950 sur OpenAlexafffund
Sharon Soodeen-Karamath, Ann M. Verrinder Gibbins

Notice bibliographique

RevueMolecular Reproduction and Development · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs
Mots-clésBiologyGermlineEmbryoGeneEmbryonic stem cellGenomeComplementary DNAGeneticsMolecular biologycDNA libraryInduced pluripotent stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The development of efficient methods for establishing germline competent chicken embryonic stem (ES) cell lines has proved elusive. In the mouse embryo, expression of oct 3/4 is limited to pluripotent cells and primordial germ cells; regulatory sequences of this gene have been used to derive germline competent mouse ES cell lines by the continuous ablation of differentiated cells in culture using drug selection. To apply this technique to chickens several strategies were employed to analyze the chicken genome for oct 3/4, a member of the highly conserved POU gene family. PCR and Southern hybridization experiments with primers and probes based on mouse oct 3/4 sequences indicated that oct 3/4-like sequences are not present in the chicken genome. Also, analysis of mRNA from Stage 14 and 20 (H&H) chick embryos by reverse transcription PCR and the screening of a Stage 20 (H&H) chick embryo cDNA library with mouse oct 3/4-based primers and probes indicated that oct 3/4-like sequences are not expressed in the early chick embryo. The apparent absence of oct 3/4 in chickens, despite the conservation of the gene in mammals and urodeles, is discussed in terms of possible implications for the mode of chicken PGC formation in relation to that in other vertebrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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