PL-I of <i>Spisula solidissima</i>, a Highly Elongated Sperm-Specific Histone H1
Notice bibliographique
Résumé
The major chromosomal protein of the mature sperm of the surf clam, Spisula solidissima, is a histone H1-related protamine-like (PL-I) protein of low electrophoretic mobility. We report here the complete sequence of two isoforms of its encoding genes. These genes encode a protein of 453 and 454 amino acids, respectively. The predicted mass of the larger isoforms (51,437 Da) was confirmed using electrospray ionization mass spectrometry. The amino-terminal tail of the S. solidissima PL-I is greatly elongated because of the presence of 39 tandem hexapeptide repeats of the motif (K/R)KRSAS with a few semiconservative amino acid substitutions. These repeats are very closely mirrored by their encoding DNA sequence, which indicates that an expansion because of sequence duplication most likely occurred. The C-terminal domain consists of a histone H1-related core with a predicted winged-helix tertiary structure, which is followed by an unstructured lysine-rich tail. This information provides additional molecular support for the classification and underlying evolution of sperm nuclear basic proteins in bivalve molluscs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».