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Enregistrement W2083021228 · doi:10.1139/w06-141

Papaya shoot tip associated endophytic bacteria isolated from in vitro cultures and host–endophyte interaction in vitro and in vivo

2007· article· en· W2083021228 sur OpenAlexvenueno aff
Pious Thomas, Sima Kumari, Ganiga K. Swarna, T. K. S. Gowda

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobacteriumBiologyPantoeaPantoea agglomeransEndophyteMicrobiologySphingomonasMethylobacteriumEnterobacterBacteriaShootEnterobacter cloacaeBotanyPseudomonas16S ribosomal RNAEnterobacteriaceaeEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fourteen distinct bacterial clones were isolated from surface-sterilized shoot tips (approximately 1 cm) of papaya (Carica papaya L. 'Surya') planted on Murashige and Skoog (MS)-based papaya culture medium (23/50 nos.) during the 2-4 week period following in vitro culturing. These isolates were ascribed to six Gram-negative genera, namely Pantoea (P. ananatis), Enterobacter (E. cloacae), Brevundimonas (B. aurantiaca), Sphingomonas, Methylobacterium (M. rhodesianum), and Agrobacterium (A. tumefaciens) or two Gram-positive genera, Microbacterium (M. esteraromaticum) and Bacillus (B. benzoevorans) based on 16S rDNA sequence analysis. Pantoea ananatis was the most frequently isolated organism (70% of the cultures) followed by B. benzoevorans (13%), while others were isolated from single stocks. Bacteria-harboring in vitro cultures often showed a single organism. Pantoea, Enterobacter, and Agrobacterium spp. grew actively on MS-based normal papaya medium, while Microbacterium, Brevundimonas, Bacillus, Sphingomonas, and Methylobacterium spp. failed to grow in the absence of host tissue. Supplying MS medium with tissue extract enhanced the growth of all the organisms in a dose-dependent manner, indicating reliance of the endophyte on its host. Inoculation of papaya seeds with the endophytes (20 h at OD550=0.5) led to delayed germination or slow seedling growth initially. However, the inhibition was overcome by 3 months and the seedlings inoculated with Pantoea, Microbacterium, or Sphingomonas spp. displayed significantly better root and shoot growths.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,682
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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