Does HPV type affect outcome in oropharyngeal cancer?
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: An epidemic of human papillomavirus (HPV)-related oropharyngeal squamous cell cancer (OPSCC) has been reported worldwide largely due to oral infection with HPV type-16, which is responsible for approximately 90% of HPV-positive cases. The purpose of this study was to determine the rate of HPV-positive oropharyngeal cancer in Southwestern Ontario, Canada. METHODS: A retrospective search identified ninety-five patients diagnosed with OPSCC. Pre-treatment biopsy specimens were tested for p16 expression using immunohistochemistry and for HPV-16, HPV-18 and other high-risk subtypes, including 31,33,35,39,45,51,52,56,58,59,67,68, by real-time qPCR. RESULTS: Fifty-nine tumours (62%) were positive for p16 expression and fifty (53%) were positive for known high-risk HPV types. Of the latter, 45 tumors (90%) were identified as HPV-16 positive, and five tumors (10%) were positive for other high-risk HPV types (HPV-18 (2), HPV-67 (2), HPV-33 (1)). HPV status by qPCR and p16 expression were extremely tightly correlated (p < 0.001, Fishers exact test). Patients with HPV-positive tumors had improved 3-year overall (OS) and disease-free survival (DFS) compared to patients with HPV-negative tumors (90% vs 65%, p = 0.001; and 85% vs 49%, p = 0.005; respectively). HPV-16 related OPSCC presented with cervical metastases more frequently than other high-risk HPV types (p = 0.005) and poorer disease-free survival was observed, although this was not statistically significant. CONCLUSION: HPV-16 infection is responsible for a significant proportion of OPSCC in Southwestern Ontario. Other high-risk subtypes are responsible for a smaller subset of OPSCC that present less frequently with cervical metastases and may have a different prognosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».