MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2083073659 · doi:10.1147/rd.492.0465

Custom math functions for molecular dynamics

2005· article· en· W2083073659 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueIBM Journal of Research and Development · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAlgorithms and Data Compression
Établissements canadiensIBM (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCompilerIBMFortranComputer scienceParallel computingSupercomputerFolding (DSP implementation)ImplementationThroughputPoint (geometry)Programming languageComputational scienceComputer architectureOperating systemMathematicsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

While developing the protein folding application for the IBM Blue Gene®/L supercomputer, some frequently executed computational kernels were encountered. These were significantly more complex than the linear algebra kernels that are normally provided as tuned libraries with modern machines. Using regular library functions for these would have resulted in an application that exploited only 5–10% of the potential floating-point throughput of the machine. This paper is a tour of the functions encountered; they have been expressed in C++ (and could be expressed in other languages such as Fortran or C). With the help of a good optimizing compiler, floating-point efficiency is much closer to 100%. The protein folding application was initially run by the life science researchers on IBM POWER3™ machines while the computer science researchers were designing and bringing up the Blue Gene/L hardware. Some of the work discussed resulted in enhanced compiler optimizations, which now improve the performance of floating-point-intensive applications compiled by the IBM VisualAge® series of compilers for POWER3, POWER4™, POWER4+™, and POWER5™. The implementations are offered in the hope that they may help in other implementations of molecular dynamics or in other fields of endeavor, and in the hope that others may adapt the ideas presented here to deliver additional mathematical functions at high throughput.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,964
Score d'incertitude au seuil0,178

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle