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Enregistrement W2083149560 · doi:10.4161/chan.5.1.14818

Structural insights into the cytoplasmic domain of a human BK channel

2011· article· en· W2083149560 sur OpenAlexaff
Andrew P. Braun

Notice bibliographique

RevueChannels · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBK channelGatingBiophysicsCytoplasmChemistryPotassium channelKcsA potassium channelProtein subunitIon channelCrystallographyCell biologyBiologyBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The large conductance, voltage- and Ca2+-activated K+ (BK or Slo1) channel is widely expressed in mammalian cells/tissues (i.e. neurons, skeletal and smooth muscles, exocrine cells, the inner ear) and regulates action potential firing, muscle contraction and secretion. The large ionic conductance and unusual, dual stimulus-driven gating behavior of this channel have long intrigued membrane biophysicists, and recent structure/function analyses have provided increasingly detailed insights into the molecular “bells and whistles” that regulate BK channel activity. Now, in two complementary articles published by the groups of Rod MacKinnon and Youxing Jiang, high resolution x-ray crystal structures of the human BK channel’s large cytoplasmic domain have been solved in both the absence and presence of bound Ca2+, conditions which would presumably promote the resting and activated conformations of this large domain. Given the regulatory importance of the cytosolic domain on BK channel gating, these experimentally determined structures reveal a number of key insights, including: 1) the physical arrangement and interactions of the tandem RCK1 and RCK2 domains within a single channel subunit, 2) the assembly of the four large cytoplasmic domains into a symmetric, tetrameric complex, 3) the formation of the channel’s “gating ring” structure, based on the assembly of the individual RCK1 and 2 domains, and 4) the structural elements underlying the regions critical for divalent metal ion binding (i.e. Ca2+ and Mg2+) and their potential influence on conduction pore opening. Commentary to: Yuan P, Leonetti MD, Pico AR, Hsiung Y, MacKinnon R. Structure of the human BK channel Ca2+-activation apparatus at 3.0 Å resolution. Science 2010; 329:182–6; PMID: 20508092; DOI: 10.1126/science.1190414; and Wu Y, Yang Y, Ye S, Jiang Y. Structure of the gating ring from the human large-conductance Ca2+-gated K+ channel. Nature 466: 393-397; PMID: 20574420; DOI: 10.1038/nature09252

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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