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Enregistrement W2083293436 · doi:10.1111/j.1600-0714.2009.00876.x

EGFR and Ki-67 expression in oral squamous cell carcinoma using tissue microarray technology

2010· article· en· W2083293436 sur OpenAlexaff
Luı́s Monteiro, Márcio Diniz Freitas, Tomás García‐Caballero, Jerónimo Forteza, Máximo Fraga

Notice bibliographique

RevueJournal of Oral Pathology and Medicine · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensHealth Sciences North
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBasal cellTissue microarrayMicroarrayPathologyCarcinomaMicroarray analysis techniquesCancer researchGene expressionGene expression profilingMedicineBiologyImmunohistochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Our aim was to validate the use of tissue microarrays (TMA) in oral squamous cell carcinomas (OSCC) to analyse epidermal growth factor receptor (EGFR) and Ki-67 expression. We also analysed the relationship that the expression of these markers may have with clinical, pathological and survival variables. PATIENTS AND METHODS: The study sample comprised 39 unselected patients diagnosed and treated for OSCC. We analysed Ki-67 and EGFR expression by immunohistochemistry on formalin-fixed, paraffin-embedded surgical specimens. Whole sections (WS) were compared with double 1.5 mm core-tissue microarrays. RESULTS: High EGFR expression was observed both on TMA (in 98% of the cases) and WS (in 100% of the cases) with substantial agreement kappa value (0.720). EGFR expression was not significantly associated with clinical, pathological and survival variables on TMA and WS. Ki-67 analysis showed a Spearman correlation of 0.741 with a Ki-67 mean labelling index of 45% in TMA and 56.8% in WS. We found a significant relationship between gender and Ki-67 labelling index on WS (P = 0.022) and TMA (P = 0.002). Clinical stage was the only parameter in multivariate analysis that had a significant predictive value. CONCLUSION: We demonstrate that dual 1.5 mm core TMA is a valid, rapid, economical and tissue-saving way to study OSCC biopsies and that it presents strong correlation with the WS. EGFR overexpression in OSCC suggests that these tumours may be a candidate for therapy investigation directed to EGFR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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