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Enregistrement W2083343296 · doi:10.1073/pnas.1031727100

Susceptibility to tuberculosis: A locus on mouse chromosome 19 (Trl-4) regulates Mycobacterium tuberculosis replication in the lungs

2003· article· en· W2083343296 sur OpenAlexaff
Loukia-Maria Mitsos, Lon R. Cardon, Lynn Ryan, Ronald LaCourse, R J North, Philippe Gros

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteWellcome Trust
Mots-clésBiologyLocus (genetics)TuberculosisMycobacterium tuberculosisAlleleGeneticsVirologyImmunologyGenePathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mouse DBA/2 (D2) strain is very susceptible to infection with virulent Mycobacterium tuberculosis, whereas C57BL/6 (B6) is much more resistant. Infection of D2 and B6 mice with M. tuberculosis H37Rv by the respiratory route is biphasic: during the first 3 weeks, there is rapid bacterial growth in the lung of both strains, whereas beyond this point replication stops in B6 but continues in D2, causing rapidly fatal pulmonary disease. To identify the genes regulating growth of M. tuberculosis in the lungs of these two strains, 98 informative (B6 x D2) F2 mice were infected by the respiratory route with M. tuberculosis H37Rv (2 x 102 colony-forming units), and the extent of bacterial replication in the lungs at 90 days was used as a quantitative measure of susceptibility in a whole-genome scan. Quantitative trait locus mapping identified a major locus on chromosome 19 (Tuberculosis resistance locus-4, Trl-4; logarithm of odds 5.6), which regulated pulmonary replication of M. tuberculosis and accounted for 25% of the phenotypic variance. B6 alleles at Trl-4 were inherited in an incompletely dominant fashion and associated with reduced bacterial replication. An additional effect of a locus (Trl-3), previously shown to affect survival to i.v. infection with M. tuberculosis, was also noted. F2 mice homozygous for B6 alleles at both Trl-3 and Trl-4 were as resistant as B6 parents, whereas mice homozygous for D2 alleles were as susceptible as D2 parents. These results suggest a strong genetic interaction between Trl-3 and Trl-4 in regulating pulmonary replication of M. tuberculosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,408
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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