Transcriptional responses to low temperature and their regulation in <i>Arabidopsis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Recent studies have used a transcriptional profiling approach to identify genes in Arabidopsis that respond at the level of transcript abundance to cold (4 °C) or chilling (13 °C) temperatures. Results have shown that plants respond to low temperatures by altering mRNA levels of a large number of genes belonging to different independent pathways. Early transcriptional response to low temperatures frequently involves signaling pathways used to respond to other environmental stresses, indicating the existence and involvement of a complex genetic network. Genes with functions specific to low-temperature signaling pathways, and those with functions in multiple signaling pathways, especially those encoding transcription factors and other signaling molecules, have been identified based on their transcriptional responses to different environmental stresses. The qualitative and quantitative difference in transcriptional response to chilling and cold suggests that plants might have different molecular mechanisms to acclimate to different types of low-temperature stresses. The regulation and interactions of genes involved in low-temperature response at the transcriptional level has been further explored by computational methods, and preliminary results have identified motifs that are known to be important for cold response, raising the possibility of a better understanding of the processes involved.Key words: Arabidopsis, low-temperature stress, gene expression, transcriptional regulation, microarray.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».