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Enregistrement W2083471941 · doi:10.1074/jbc.m800640200

Nuclear Factor-1 and Metal Transcription Factor-1 Synergistically Activate the Mouse Metallothionein-1 Gene in Response to Metal Ions

2008· article· en· W2083471941 sur OpenAlexaff
Olivier LaRochelle, Simon Labbé, Jean-François Harrisson, Carl Simard, Véronique Tremblay, Geneviève St-Gelais, Manjapra V. Govindan, Carl Séguin

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversité LavalHôtel-Dieu de Québec
Organismes subventionnairesU.S. Forest Service
Mots-clésMolecular biologyPromoterTranscription factorChromatin immunoprecipitationTransfectionMetallothioneinResponse elementBiologyBinding siteTranscription (linguistics)Electrophoretic mobility shift assayZinc fingerSp1 transcription factorGeneChemistryGene expressionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metal activation of metallothionein (MT) gene transcription is dependent on the presence of metal regulatory elements (MREs), which are present in five non-identical copies (MREa through MREe) in the promoter of the mouse MT-1 gene and on the capacity of metal transcription factor-1 (MTF-1) to bind to the MREs in the presence of zinc. We detected a protein, distinct from MTF-1, specifically binding to the MREc region. DNA binding competition experiments using synthetic oligonucleotides and specific anti-NF1 antibodies showed that this protein binds to an NF1 site overlapping the MREc element as well as to a second site upstream of the Sp1a site and corresponds to NF1 or a related protein. Transfection experiments showed that loss of the two NF1 sites decreased metal-induced MT promoter activity by 55-70% in transiently transfected cells and almost completely abrogated metal and tert-butylhydroquinone (tBHQ) induction in stably transfected cells. Similarly, expression of an inactive NF1 protein strongly inhibited MT-1 promoter activity. Using synthetic promoters containing NF1 and MRE sites fused to a minimal MT promoter, we showed that these NF1 sites did not confer metal induction but enhanced metal-induced promoter activity. Chromatin immunoprecipitation assays confirmed that NF1 binds to the mouse MT-1 promoter in vivo and showed that NF1 binding is zinc-inducible. In addition, zinc-induced NF1 DNA binding was MTF-1-dependent. Taken together, these studies show that NF1 acts synergistically with MTF-1 to activate the mouse MT-1 promoter in response to metal ions and tert-butylhydroquinone and contributes to maximal activation of the gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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