Abstract 3916: PML nuclear bodies are juxtaposed to DNA-DSBs following IR-induced DNA damage
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The promyelocytic leukemia (PML) tumor suppressor protein aggregates in discrete PML nuclear bodies (PML-NBs) that are detectable by immunofluorescent microscopy. PML-NB number can change in response to cell cycle and various cell stresses, including DNA damage. Intra-nuclear γH2AX foci form following ionizing radiation (IR) as a function of dose and time and are used as an indicator of DNA double strand breaks (DNA-DSBs). However, whether PML-NBs are associated with exogenous or endogenous (e.g. DNA replication associated) damage was unclear. Using G0-G1 synchronized human fibroblast (GM05757) to exclude endogenous DNA damage, we examined the intra-nuclear locales of γH2AX and other DNA repair biomarkers with respect to PML-NBs following IR. PML +/+ and -/- MEFs did not vary in DNA-DSB repair based on comet assay. Consistent with this, PML-NBs did not respond to immediate DNA damage. However, 3D-confocal microscopy studies showed that PML-NBs associated with the majority of residual γH2AX sites at later times (24h post-IR). Using quantitative microscopy, these associations were distinguishable as juxtaposition and not true co-localization (i.e., between γH2AX and DSB marker 53BP1). Continued presence of damage sensing and signaling proteins (MRE11, NBS1, MDC1 and 53BP1) and persistent kinase activity (DNA-PK, ATM, CHK2) was observed at these residual γH2AX sites. Absence of RAD51 and BRCA1 indicated that these were not replication-associated breaks and the exclusion of TRF2 suggested that these were not telomeric regions; rather PML-NBs associated specifically with unrepaired exogenous DSBs. Residual γH2AX sites were not enriched in eu- or heterochromatin. Interestingly, scanning electron imaging revealed a lower chromatin density near residual γH2AX foci, suggesting chromatin remodeling in the vicinity of unrepaired breaks. Live cell experiment using GFP-PML IV and mCherry-53BP1tudor domain suggested that PML-NB mobility facilitated the association with residual 53BP1 foci. Our data suggests that maintenance of genomic stability may depend, in part, on the association between PML-NBs and residual γH2AX foci. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 3916. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-3916
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».