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Enregistrement W2083498261 · doi:10.1039/c4mb00027g

The intrinsic disorder status of the human hepatitis C virus proteome

2014· article· en· W2083498261 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular BioSystems · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteomeHepatitis a virusHuman proteome projectHepatitis C virusBiologyVirologyVirusComputational biologyProteomicsBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many viral proteins or their biologically important regions are disordered as a whole, or contain long disordered regions. These intrinsically disordered proteins/regions do not possess unique structures and possess functions that complement the functional repertoire of "normal" ordered proteins and domains, with many protein functional classes being heavily dependent on the intrinsic disorder. Viruses commonly use these highly flexible regions to invade the host organisms and to hijack various host systems. These disordered regions also help viruses in adapting to their hostile habitats and to manage their economic usage of genetic material. In this article, we focus on the structural peculiarities of proteins from human hepatitis C virus (HCV) and use a wide spectrum of bioinformatics techniques to evaluate the abundance of intrinsic disorder in the completed proteomes of several human HCV genotypes, to analyze the peculiarities of disorder distribution within the individual HCV proteins, and to establish potential roles of the structural disorder in functions of ten HCV proteins. We show that the intrinsic disorder or increased flexibility is not only abundant in these proteins, but is also absolutely necessary for their functions, playing a crucial role in the proteolytic processing of the HCV polyprotein, the maturation of the individual HCV proteins, and being related to the posttranslational modifications of these proteins and their interactions with DNA, RNA, and various host proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,393
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle