Exploration of fluorescent protein voltage probes based on circularly permuted fluorescent proteins
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Genetically encoded fluorescent protein (FP) voltage sensors are promising tools for optical monitoring of the electrical activity of cells. Over the last decade, several designs of fusion proteins have been explored and some of them have proven to be sensitive enough to record membrane voltage transients from single mammalian cells. Most prominent are the families of voltage sensitive fluorescent proteins (VSFPs) that utilize the voltage sensor domain (VSD) of Ciona intestinalis voltage sensor-containing phosphatase (Ci-VSP). The voltage sensitivity of the fluorescence readout of these previously reported membrane potential indicators is achieved either via a change in the efficiency of fluorescence resonance energy transfer between two FP spectral variants or via modulation in the fluorescence intensity of a single FP. Here, we report our exploration on a third VSFP design principle based on circularly permuted fluorescent protein (cpFP) variants. Using circularly permuted EGFP derived from GCaMP2 and two newly generated circularly permuted variants of the far-red emitting protein named mKate, we generated and characterized a series of voltage-sensitive probes wherein the cpFPs were fused to the VSD of Ci-VSP. The most promising variants were based on circularly permuted mKate with new N- and C-termini given by residues 180 and 182. Even so their voltage sensitivity was relatively modest, they constitute a proof of principle for this novel protein design.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle