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Enregistrement W2083600030 · doi:10.1371/journal.pone.0046056

Cryptic Diversity in the Ubiquist Species Parisotoma notabilis (Collembola, Isotomidae): A Long-Used Chimeric Species?

2012· article· en· W2083600030 sur OpenAlexfundno aff
David Porco, Mikhail Potapov, Anne Bedòs, Galina Buşmachiu, Wanda Maria Weiner, Salah Hamra-Kroua, Louis Deharveng

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCollembola Taxonomy and Ecology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario GenomicsOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésBiologySpecies complexEcologyGenetic divergenceEvolutionary biologyGenetic diversityZoologyPhylogenetic treePopulationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parisotoma notabilis is the most common species of Collembola in Europe and is currently designated as ubiquist. This species has been extensively used in numerous studies and is considered as well characterized on a morphological ground. Despite the homogeneity of its morphology, the sequencing of the barcoding fragment (5' end of COI) for several populations throughout Europe and North America revealed four distinct genetic lineages. The divergence found between these lineages was similar to the genetic distance among other species of the genus Parisotoma included in the analysis. All four lineages have been confirmed by the nuclear gene 28S. This congruence between mitochondrial and nuclear signals, as well as the geographical distribution pattern of lineages observed in Europe, supports the potential specific status of these lineages. Based on specimens from the type locality (Hamburg), the species name was successfully assigned to one of these lineages. This finding raises several problems as Parisotoma notabilis has been widely used in many ecological studies. Accumulation of new data for the different lineages detected, especially ecological information and life history traits, is needed to help resolve this situation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,097 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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