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Enregistrement W2083730819 · doi:10.1182/blood-2013-02-481507

NOTCH2 and FLT3 gene mis-splicings are common events in patients with acute myeloid leukemia (AML): new potential targets in AML

2014· article· en· W2083730819 sur OpenAlexafffund
Sophia Adamia, Michal Bar‐Natan, Benjamin Haibe‐Kains, Patrick M. Pilarski, Christian Bach, Samuel Pevzner, Teresa Calimeri, Hervé Avet‐Loiseau, Laurence Lodé, Sigitas Verselis, Edward A. Fox, Ilene Galinsky, Steven N. Mathews, Ibiayi Dagogo‐Jack, Martha Wadleigh, David P. Steensma, Gabriela Motyckova, Daniel J. DeAngelo, John Quackenbush, Daniel G. Tenen, Richard M. Stone, James D. Griffin

Notice bibliographique

RevueBlood · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of AlbertaMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Cancer InstituteUniversity of AlbertaAmerican Society of HematologyAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésBiologyMyeloid leukemiaAlternative splicingCancer researchGenespliceExonMyeloidRNA splicingLeukemiaBone marrowGeneticsImmunologyRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our previous studies revealed an increase in alternative splicing of multiple RNAs in cells from patients with acute myeloid leukemia (AML) compared with CD34(+) bone marrow cells from normal donors. Aberrantly spliced genes included a number of oncogenes, tumor suppressor genes, and genes involved in regulation of apoptosis, cell cycle, and cell differentiation. Among the most commonly mis-spliced genes (>70% of AML patients) were 2, NOTCH2 and FLT3, that encode myeloid cell surface proteins. The splice variants of NOTCH2 and FLT3 resulted from complete or partial exon skipping and utilization of cryptic splice sites. Longitudinal analyses suggested that NOTCH2 and FLT3 aberrant splicing correlated with disease status. Correlation analyses between splice variants of these genes and clinical features of patients showed an association between NOTCH2-Va splice variant and overall survival of patients. Our results suggest that NOTCH2 and FLT3 mis-splicing is a common characteristic of AML and has the potential to generate transcripts encoding proteins with altered function. Thus, splice variants of these genes might provide disease markers and targets for novel therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil0,599

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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