The DNA Damage Response Pathway Regulates the Alternative Splicing of the Apoptotic Mediator Bcl-x
Notice bibliographique
Résumé
Alternative splicing often produces effectors with opposite functions in apoptosis. Splicing decisions must therefore be tightly connected to stresses, stimuli, and pathways that control cell survival and cell growth. We have shown previously that PKC signaling prevents the production of proapoptotic Bcl-x(S) to favor the accumulation of the larger antiapoptotic Bcl-x(L) splice variant in 293 cells. Here we show that the genotoxic stress induced by oxaliplatin elicits an ATM-, CHK2-, and p53-dependent splicing switch that favors the production of the proapoptotic Bcl-x(S) variant. This DNA damage-induced splicing shift requires the activity of protein-tyrosine phosphatases. Interestingly, the ATM/CHK2/p53/tyrosine phosphatases pathway activated by oxaliplatin regulates Bcl-x splicing through the same regulatory sequence element (SB1) that receives signals from the PKC pathway. Convergence of the PKC and DNA damage signaling routes may control the abundance of a key splicing repressor because SB1-mediated repression is lost when protein synthesis is impaired but is rescued by blocking proteasome-mediated protein degradation. The SB1 splicing regulatory module therefore receives antagonistic signals from the PKC and the p53-dependent DNA damage response pathways to control the balance of pro- and antiapoptotic Bcl-x splice variants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».