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Enregistrement W2083770549 · doi:10.1021/bi035587j

Peptide-Induced Formation of Cholesterol-Rich Domains

2003· article· en· W2083770549 sur OpenAlexaff
Richard M. Epand, Brian G. Sayer

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryPeptideBilayerCholesterolMembranePhospholipidNuclear magnetic resonance spectroscopyAmideLipid bilayerStereochemistryBiochemistryBiophysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The peptide N-acetyl-LWYIK-amide causes the reorganization of bilayers of phosphatidylcholine and cholesterol to produce domains enriched in cholesterol. At a cholesterol mol fraction of 0.5, addition of N-acetyl-LWYIK-amide results in the formation of cholesterol crystallites. Addition of this peptide to mixtures of 1-stearoyl-2-oleoylphosphatidylcholine with lower mol fractions of cholesterol results in an increase in the enthalpy of the chain melting transition of the phospholipid, indicating the depletion of cholesterol from a domain in the membrane. The peptide binds to membranes both with and without cholesterol. However, (1)H magic-angle spinning (MAS) nuclear Overhauser effect spectroscopy (NOESY) indicates that in the presence of cholesterol the peptide has greater penetration into the bilayer. (13)C MAS NMR indicates that the peptide has stronger interactions with the A ring of cholesterol than it does with the interior of the bilayer. These results are in contrast with those of another peptide, N-acetyl-KYWFYR-amide, which does not promote the formation of cholesterol crystallites and does not show preferential interaction with cholesterol by NMR. Therefore, cholesterol can promote the insertion of N-acetyl-LWYIK-amide into a membrane and this peptide will sequester cholesterol into domains. These properties help to explain the observation that this sequence is found to be important in causing the fusion protein of human immunodeficiency virus (HIV) to sequester into raft domains in biological membranes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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