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Enregistrement W2083822594 · doi:10.1371/journal.pone.0019118

Intracellular Eukaryotic Parasites Have a Distinct Unfolded Protein Response

2011· article· en· W2083822594 sur OpenAlexafffund
Sara J.C. Gosline, Mirna Nascimento, Laura‐Isobel McCall, Dan Zilberstein, David Y. Thomas, Greg Matlashewski, Michael Hallett

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésUnfolded protein responseEndoplasmic reticulumATF6Cell biologyBiologySignal transductionProtein foldingTranslation (biology)PhosphorylationChaperone (clinical)Protein biosynthesisEndoplasmic-reticulum-associated protein degradationBiochemistryMessenger RNAMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Insult to the endoplasmic reticulum (ER) activates the Unfolded Protein Response (UPR), a set of signaling pathways that protect the cell from the potential damage caused by improperly folded proteins. Accumulation of misfolded proteins in the ER lumen initiates a series of signal transduction events via activation of three transmembrane ER proteins: Ire1, Atf6 and PERK. Activation of these proteins results in the transcriptional up-regulation of the components of the folding, trafficking and degradation machinery in the ER. PERK further reduces the load on the ER via the phosphorylation of eIF2α, attenuating general protein translation. It is believed that the UPR evolved as a transcriptional response that up-regulates protein folding machinery in the ER and later gained the ability to decrease ER load by attenuating general protein translation in metazoa. However, our in silico analyses of protozoan parasites revealed an absence of proteins involved in the transcriptionally mediated UPR and the presence of both PERK and its target eIF2α. Consistent with these observations, stimulation of the UPR in Leishmania donovani identified an absence of up-regulation of the ER chaperone BiP, the canonical ER chaperone modulated by the UPR in higher eukaryotes, while exhibiting increased phosphorylation of eIF2α which has been shown to attenuate protein translation. We further observed that L. donovani is more sensitive to UPR inducing agents than host macrophages, suggesting that the less evolved stress response could provide a new avenue for therapeutic treatment of parasitic infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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