Intracellular Eukaryotic Parasites Have a Distinct Unfolded Protein Response
Notice bibliographique
Résumé
Insult to the endoplasmic reticulum (ER) activates the Unfolded Protein Response (UPR), a set of signaling pathways that protect the cell from the potential damage caused by improperly folded proteins. Accumulation of misfolded proteins in the ER lumen initiates a series of signal transduction events via activation of three transmembrane ER proteins: Ire1, Atf6 and PERK. Activation of these proteins results in the transcriptional up-regulation of the components of the folding, trafficking and degradation machinery in the ER. PERK further reduces the load on the ER via the phosphorylation of eIF2α, attenuating general protein translation. It is believed that the UPR evolved as a transcriptional response that up-regulates protein folding machinery in the ER and later gained the ability to decrease ER load by attenuating general protein translation in metazoa. However, our in silico analyses of protozoan parasites revealed an absence of proteins involved in the transcriptionally mediated UPR and the presence of both PERK and its target eIF2α. Consistent with these observations, stimulation of the UPR in Leishmania donovani identified an absence of up-regulation of the ER chaperone BiP, the canonical ER chaperone modulated by the UPR in higher eukaryotes, while exhibiting increased phosphorylation of eIF2α which has been shown to attenuate protein translation. We further observed that L. donovani is more sensitive to UPR inducing agents than host macrophages, suggesting that the less evolved stress response could provide a new avenue for therapeutic treatment of parasitic infections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».