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Enregistrement W2083846731 · doi:10.1074/jbc.m208488200

Engineering Competitive Magnesium Binding into the First EF-hand of Skeletal Troponin C

2002· article· en· W2083846731 sur OpenAlexaff
Jonathan P. Davis, Jack A. Rall, Peter J. Reiser, Lawrence B. Smillie, Svetlana B. Tikunova

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of HealthNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesAmerican Heart Association
Mots-clésMagnesiumTroponin CChemistryCalciumBiophysicsCrystallographyStereochemistryTroponinBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The goal of this study was to examine the mechanism of magnesium binding to the regulatory domain of skeletal troponin C (TnC). The fluorescence of Trp(29), immediately preceding the first calcium-binding loop in TnC(F29W), was unchanged by addition of magnesium, but increased upon calcium binding with an affinity of 3.3 microm. However, the calcium-dependent increase in TnC(F29W) fluorescence could be reversed by addition of magnesium, with a calculated competitive magnesium affinity of 2.2 mm. When a Z acid pair was introduced into the first EF-hand of TnC(F29W), the fluorescence of G34DTnC(F29W) increased upon addition of magnesium or calcium with affinities of 295 and 1.9 microm, respectively. Addition of 3 mm magnesium decreased the calcium sensitivity of TnC(F29W) and G34DTnC(F29W) approximately 2- and 6-fold, respectively. Exchange of G34DTnC(F29W) into skinned psoas muscle fibers decreased fiber calcium sensitivity approximately 1.7-fold compared with TnC(F29W) at 1 mm [magnesium](free) and approximately 3.2-fold at 3 mm [magnesium](free). Thus, incorporation of a Z acid pair into the first EF-hand allows it to bind magnesium with high affinity. Furthermore, the data suggests that the second EF-hand, but not the first, of TnC is responsible for the competitive magnesium binding to the regulatory domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,227

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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