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Enregistrement W2083900953 · doi:10.1002/ijc.21954

<i>KIF14</i> mRNA expression is a predictor of grade and outcome in breast cancer

2006· article· en· W2083900953 sur OpenAlexaff
Timothy W. Corson, Brenda L. Gallie

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerOncologyInternal medicineMedicineCancerBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gain of chromosome 1q is a hallmark of breast cancer, and likely reflects oncogene amplification. We previously identified mitotic kinesin KIF14 (kinesin family member 14) as an overexpressed candidate oncogene in the 1q31.3-1q32.1 minimal region of genomic gain in breast cancer cell lines. KIF14 also showed high expression in other cancers, notably an association with survival in lung tumors. We now report KIF14 expression in 99 primary breast tumors and 10 normal breast controls. Measured by real-time RT-PCR, KIF14 was overexpressed 10-fold on average in tumors relative to normals (t test p = 0.000054); expression increased with grade (ANOVA p = 0.000006). Infiltrating ductal carcinomas had higher KIF14 levels than lobular (p = 0.017), and estrogen receptor (ER) negative tumors had higher KIF14 levels than ER positive tumors (t test p = 0.030). KIF14 expression correlated positively with Ki-67 mRNA level (Spearman r = 0.692, p = 0.000001), fraction of positive nodes (r = 0.227, p = 0.024) and percent invasive cells (r = 0.360, p = 0.0002), and negatively with percent fatty stroma (r = -0.258, p = 0.010) and percent normal epithelium (r = -0.291, p = 0.003). KIF14 expression is thus tumor-specific and increased in more aggressive tumors. Indeed, KIF14 expression predicted overall survival (univariate Cox p = 0.010), with an odds ratio of 3.60 (1.37-9.48), in 50 tumors with available outcome data. KIF14 overexpression also predicted decreased disease-free survival (log-rank p = 0.049). These findings are the first evidence of association between expression of a mitotic kinesin and prognostic variables in breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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