The Role of Proline in the Membrane Re-entrant Helix of Caveolin-1
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Caveolin-1 has a segment of hydrophobic amino acids comprising approximately residues 103-122. We have performed an in silico analysis of the conformational preference of this segment of caveolin-1 using PepLook. We find that there is one main group of stable conformations corresponding to a hydrophobic U bent model that would not traverse the membrane. Furthermore, the calculations predict that substituting the Pro(110) residue with an Ala will change the conformation to a straight hydrophobic helix that would traverse the membrane. We have expressed the P110A mutant of caveolin-1, with a FLAG tag at the N terminus, in HEK 293 cells. We evaluate the topology of the proteins with confocal immunofluorescence microscopy in these cells. We find that FLAG tag at the N terminus of the wild type caveolin-1 is not reactive with antibodies unless the cell membrane is permeabilized with detergent. This indicates that in these cells, the hydrophobic segment of this protein is not transmembrane but takes up a bent conformation, making the protein monotopic. In contrast, the FLAG tag at the N terminus of the P110A mutant is equally exposed to antibodies, before and after membrane permeabilization. We also find that the P110A mutation causes a large reduction of endocytosis of caveolae, cellular lipid accumulation, and lipid droplet formulation. In addition, we find that this mutation markedly reduces the ability of caveolin-1 to form structures with the characteristic morphology of caveolae or to partition into the detergent-resistant membranes of these cells. Thus, the single Pro residue in the membrane-inserting segment of caveolin-1 plays an important role in both the membrane topology and localization of the protein as well as its functions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle