aS1-Casein Lineage Assessed by RFLP in the Endangered Goat Breed “Retinta Extremeña”
Notice bibliographique
Résumé
The Retinta Extremeña goat is a well-adapted breed to "Dehesa" environment. Traditionally their raw milk is used to make artisan cheese. However, crosses with specialized breeds are occurring since the eighties, this goat breed has been declared of special protection by the Spanish Agriculture Ministry (R.D. 1682/1997 and R.D. 229/2008). Genetic studies about casein variants have been mainly performed on Spanish goats of high milk yields because the caseins are a relevant fraction of milk. But recent studies claimed to study the caseins in all breeds, including threatened goat breeds to decide about its conservation value. This study was focused on the aS1-casein in the endangered “Retinta Extremeña” goat for the first time to enhance its conservation interest. Genomic DNA of seventy five pureblood goats was studied. A PCR-RFLP assay was designed to find a BmyI target that distinguishing A versus B2 lineages (including recombinant variant M and B1, respectively) of the aS1-casein locus. The allelic frequency of variants related to A lineage (CAG triplet) was 14.0% similar to other southwestern Spanish breeds. It is suggested that individuals or families carrying A lineage should be more studied to detect less allergen null alleles while the opposite allele pools of the B2 lineages should be tested for alleles associated to unsaturated fatty acid content. Therefore, the priorities for conservation plans of animal genetic resources as threatened goat breeds; more investigation is claimed in the aim to study for proved useful alleles of certain genes, as casein variants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».