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Enregistrement W2083981849 · doi:10.1139/o04-058

The effect of TNF-α on glycosylation pathways in bovine synoviocytes

2004· article· en· W2083981849 sur OpenAlexafffundvenue
Xiaojing Yang, Michael Lehotay, Tassos Anastassiades, Mark Harrison, Inka Brockhausen

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesArthritis Society
Mots-clésGlycanGlycosylationGlycoproteinTumor necrosis factor alphaBiochemistryChemistryGlycosyltransferaseGlycoconjugateEnzymeInflammationExtracellular matrixLectinArthritisCell biologyBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synoviocytes are fibroblastic cells that line joint cavities. These cells synthesize numerous cell-surface and extracellular-matrix glycoproteins that are required for maintenance of the joint. Joint inflammation, such as occurs in arthritis, has been shown to have major effects on synoviocyte proliferation and on the biosynthesis of glycoproteins. The structures of the carbohydrate moieties of glycoproteins, however, and the enzymes involved in their synthesis have not yet been described for synoviocytes. Therefore, to characterize the cell-surface glycoconjugates, synoviocytes were isolated from bovine ankles, and the cells were grown in primary cultures. Lectin-binding assays were used to identify exposed N- and O-glycan carbohydrate determinants on synoviocytes, and specific enzyme assays were used to identify some of the glycosyltransferases involved in the synthesis of the glycan chains. A number of the enzymes that synthesize N- and O-linked oligosaccharides were found to be active in cell-free extracts of synoviocytes, including those that synthesize core-1-based O-glycans and the more complex bi-antennary N-glycans. To understand the molecular events underlying the inflammatory response in the synovium of arthritis patients, we examined the effect of the inflammatory cytokine tumour necrosis factor alpha (TNF-alpha) on synoviocytes and on glycosylation profiles. TNF-alpha treatment, which induces apoptosis in synoviocytes, was accompanied by changes in lectin-binding patterns, indicating alterations in the expression of cell-surface oligosaccharides. Concurrently, changes in specific enzyme activities were observed in treated cells. Two enzymes potentially important to the inflammatory process, core 2 beta6-GlcNAc-transferase and beta4-Gal-transferase, increased after TNF-alpha treatment. This is the first study of glycoprotein biosynthesis in synoviocytes, and it shows that synoviocytes have a characteristic glycosylation phenotype that is altered in the presence of inflammatory cytokines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,352

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2004
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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