Structural models for the alkaline conformers of yeast <i>iso</i>‐1‐ferricytochrome <i>c</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Abstract Structural models for three alkaline conformers of yeast iso ‐1‐ferricytochrome c have been calculated from the atomic coordinates of the native protein through the use of molecular dynamics simulation. In the three models produced by this work, the Met80 axial ligand to the heme iron has been replaced by either Lys72, Lys73, or Lys79, and the related changes in structure of the cyto‐chrome are described. The principal changes in cytochrome structure predicted to result from this pH‐linked change in axial ligation involve location of residues 70–80, a region of the protein sequence that is phylogenetically conserved. The remainder of the protein fold in each model is essentially unchanged from the structure of the native protein, which is consistent with available spectroscopic information. The observation that this highly conserved region is apparently integrally involved in this conformational change may be interpreted as indicating a possible physiological role for the pH‐linkage of ferricytochrome c structure.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle