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Enregistrement W2084026711 · doi:10.1093/jxb/erl275

Methyl recycling activities are co-ordinately regulated during plant development

2007· article· en· W2084026711 sur OpenAlexafffund
LAR Pereira, Margarita Todorova, Xiaoyin Cai, Christopher A. Makaroff, BA Moffatt

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant responses to water stress
Établissements canadiensTrent UniversityUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgMcMaster University
Mots-clésArabidopsisMeristemBiochemistryChemistrySiliqueArabidopsis thalianaEnzymeBiologyMolecular biologyCell biologyGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A large number of compounds including lignin, phospholipids, pectin, DNA, mRNA, and proteins require methyl groups for their functionality. A detailed study of the expression and activities of two enzymes, adenosine kinase (ADK) and S-adenosylhomocysteine hydrolase (SAHH), which are both required for the maintenance and recycling of S-adenosylmethionine-dependent methylation in plants, was carried out. The abundance and tissue localization of ADK and SAHH transcripts and protein were monitored along with their enzyme activities in leaves, stems, buds, siliques, and roots of Arabidopsis. In all but roots and seed coats, the transcript abundance of ADK and SAHH fluctuated co-ordinately, matching changes in their protein and enzyme activities. To evaluate whether this expression pattern was associated with methyl recycling, the protein content and distribution of S-adenosylmethionine synthetase and phosphoethanolamine N-methyltransferase, a key methyltransferase involved in phospholipid synthesis, were investigated. These were found to accumulate in a pattern similar to ADK and SAHH. ADK and SAHH protein and transcript amounts were shown to fluctuate similarly in tissues accumulating lignin. Additionally, the amounts of ADK and SAHH mRNAs were also found at high levels in inflorescence meristems likely to support their higher rates of cell division. Thus, the results point to a co-ordinated and probably transcriptional regulation of these genes in most organs of Arabidopsis; SAHH abundance is distinctly higher in seeds and roots which suggests it may have a non-methyl-related role in these organs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,282

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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