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Enregistrement W2084039866 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-350

Abstract 350: Claudin 1 expression in the basal-like breast cancer subtype (BLBC) is age related and higher in postmenopausal women

2012· article· en· W2084039866 sur OpenAlexaff
Anne Blanchard, Xiuli Ma, Carla Penner, Sandy Lee, Drew Mulhall, Steven Cooper, Etienne Leygue, Leigh C. Murphy, Yvonne Myal

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBarrier Structure and Function Studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClaudinTight junctionGene knockdownBreast cancerTransfectionCancer researchBiologyCancerCell cultureInternal medicineCell biologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The claudins are a family of tight junction (TJ) proteins that are crucial for the organization of epithelial cell polarity, contribute to the transepithelial barrier that controls the transport of ions and small molecules and the overall maintenance of the differentiated state of epithelial cells. An absence of, or defects in tight junctions have been associated with development of the neoplastic phenotype. Claudin 1, a member of this family forms the backbone of the TJ strand and is primarily responsible for the regulation of the paracellular pathway function in epithelial cells. However, the role of claudin 1 in breast cancer is not known, but studies from our laboratory and others suggest that it may be that of a tumor suppressor. Paradoxically, our laboratory has also shown that claudin 1 protein expression is significantly higher in a particular subset of breast cancers, the basal-like subtype, an aggressive form of breast cancer associated with poor prognosis. To begin to delineate a direct functional role for claudin 1 in basal-like breast cancer (BLBC), we generated in vitro, a stably transfected shRNA claudin 1 knockdown model, using the basal-like BT20 human breast cancer (HBC) cell line which over-expresses endogenous claudin 1. As well, we over-expressed claudin 1 in another basal-like HBC cell line, MDA-MB231, which expresses low levels of endogenous claudin 1. Claudin 1 gene knockdown/over-expression was confirmed by western blot analysis. Cell cultures were then evaluated for changes in proliferation and migration. The differential expression of genes associated with epithelial-mesenchymal transition in the claudin 1 gene knockdown/over-expression clones was also investigated by qPCR using PCR arrays. Several significantly differentially expressed genes, such as BMP7, PAI1and SPP1 were identified. Additionally, to examine the clinical relevance of high claudin 1 in the basal-like human invasive breast cancers, we generated a BLBC tissue microarray and interrogated the association of high claudin 1 expression and patient survival and disease recurrence. In our cohort we found no correlation with claudin 1 expression with either of these parameters, but a significant association with age (p=0.0022). High claudin 1 expression was significantly associated with BLBC from postmenopausal women > 55 years of age. The heterogeneous nature of the disease presentation of breast cancer and the limitations in identifying clinically relevant subsets of patients are major challenges for current breast cancer diagnostic and therapeutic strategies. These studies will provide information which would further define this subset of breast cancer that is particularly difficult to treat. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 350. doi:1538-7445.AM2012-350

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,812
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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