Differential Regulation of the Aldehyde Dehydrogenase 1 Gene in Embryonic Chick Retina and Liver
Notice bibliographique
Résumé
Aldehyde dehydrogenase (ALDH1) is highly expressed in the dorsal cells of the undifferentiated retina, where it has been proposed to play a role in the formation of a retinoic acid gradient along the ventrodorsal axis. In contrast to the retina, ALDH1 levels increase with differentiation in the liver and remain elevated in the adult tissue. To understand the molecular basis for differential expression of ALDH1 during development, we characterized the ALDH1 transcripts expressed in chick retina and liver. By sequencing, primer extension, and S1 nuclease analysis, we show that retina ALDH1 mRNA has an additional 300 nucleotides of 5'-untranslated sequence resulting from the transcription of two 5' noncoding exons. There is a 24-29-kilobase pair (kb) gap between exons 1 and 2 and a 290-base pair gap between exons 2 and 3. Exon 3, which contains the ALDH1 start codon, represents the first exon of the liver transcript. Using a reporter gene assay, we have identified tissue-specific regulatory elements that govern ALDH1 expression in primary retina and liver cultures. Constructs with >1.6 kb of DNA flanking the 5'-end of exon 1 showed elevated activity in retinal cultures but only basal activity in liver cultures. In contrast, constructs with <1 kb of 5'-flanking DNA were active in both retina and liver cultures. Our results suggest that an important mechanism for the control of ALDH1 transcriptional activity is through the presence of inhibitory elements located 0.7-1.6 kb upstream of the ALDH1 gene. DNase I footprint analysis reveal four sites of protein-DNA interaction within this region, one of which is specific to the liver and corresponds to a NF-kappaB/Rel binding site.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».