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Enregistrement W2084175517 · doi:10.1074/jbc.m808136200

Vesicular Stomatitis Virus Matrix Protein Mutations That Affect Association with Host Membranes and Viral Nucleocapsids

2008· article· en· W2084175517 sur OpenAlexaboutno aff
Brooke A. Dancho, Margie O. McKenzie, John H. Connor, Douglas S. Lyles

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthWake Forest University
Mots-clésVesicular stomatitis virusViral matrix proteinVirologyHost (biology)MembraneMatrix (chemical analysis)MutationVirusVesicular stomatitis Indiana virusBiologyGeneChemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Viral matrix (M) proteins bind the nucleoprotein core (nucleocapsid) to host membranes during the process of virus assembly by budding. Previous studies using truncated M proteins had implicated the N-terminal 50 amino acids of the vesicular stomatitis virus M protein in binding both membranes and nucleocapsids and a sequence from amino acids 75-106 as an additional membrane binding region. Structure-based mutations were introduced into these two regions, and their effects on membrane association and incorporation into nucleocapsid-M protein complexes were determined using quantitative assays. The results confirmed that the N terminus of M protein is involved in association with plasma membranes as well as nucleocapsids, although these two activities were differentially affected by individual mutations. Mutations in the 75-106 region affected incorporation into nucleocapsid-M complexes but had only minor effects on association with membranes. The ability of site-specific mutant M proteins to complement growth of temperature-sensitive M mutant virus did not correlate well with the ability to associate with membranes or nucleocapsids, suggesting that complementation involves an additional activity of M protein. Mutants with similar abilities to associate with membranes and nucleocapsids but differing in complementation activity were incorporated into infectious cDNA clones. Infectious virus was repeatedly recovered containing mutant M proteins capable of complementation but was never recovered with mutant M proteins that lacked complementation activity, providing further evidence for a separate activity of M protein that is essential for virus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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