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Enregistrement W2084184971 · doi:10.1371/journal.pone.0002853

Three-Dimensional Analysis of Vascular Development in the Mouse Embryo

2008· article· en· W2084184971 sur OpenAlexafffund
Johnathon R. Walls, Leigh Coultas, Janet Rossant, R. Mark Henkelman

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAngiogenesis and VEGF in Cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationToronto Centre for PhenogenomicsHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenTerry Fox Foundation
Mots-clésSprouting angiogenesisAngiogenesisVascular remodelling in the embryoBiologyAnatomyPlexusEmbryoPhenotypeCD31Embryonic stem cellVasculogenesisPathologyCell biologyNeovascularizationGeneticsMedicineStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Key vasculogenic (de-novo vessel forming) and angiogenic (vessel remodelling) events occur in the mouse embryo between embryonic days (E) 8.0 and 10.0 of gestation, during which time the vasculature develops from a simple circulatory loop into a complex, fine structured, three-dimensional organ. Interpretation of vascular phenotypes exhibited by signalling pathway mutants has historically been hindered by an inability to comprehensively image the normal sequence of events that shape the basic architecture of the early mouse vascular system. We have employed Optical Projection Tomography (OPT) using frequency distance relationship (FDR)-based deconvolution to image embryos immunostained with the endothelial specific marker PECAM-1 to create a high resolution, three-dimensional atlas of mouse vascular development between E8.0 and E10.0 (5 to 30 somites). Analysis of the atlas has provided significant new information regarding normal development of intersomitic vessels, the perineural vascular plexus, the cephalic plexus and vessels connecting the embryonic and extraembryonic circulation. We describe examples of vascular remodelling that provide new insight into the mechanisms of sprouting angiogenesis, vascular guidance cues and artery/vein identity that directly relate to phenotypes observed in mouse mutants affecting vascular development between E8.0 and E10.0. This atlas is freely available at http://www.mouseimaging.ca/research/mouse_atlas.html and will serve as a platform to provide insight into normal and abnormal vascular development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations208
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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