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Enregistrement W2084362175 · doi:10.1139/g04-118

Application of ISSR, RAPD, and cytological markers to the certification of <i>Picea mariana, P. glauca</i>, and <i>P. engelmannii</i> trees, and their putative hybrids

2005· article· en· W2084362175 sur OpenAlexafffundvenue
K. K. Nkongolo, P Michael, T Demers

Notice bibliographique

RevueGenome · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest ecology and management
Établissements canadiensLaurentian University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRAPDBiologyHybridPicea engelmanniiBotanyGenetic markerMicrosatelliteGeneticsPopulationGenetic diversityPinus contortaAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Picea glauca (white spruce) and P. engelmannii (Engelmann spruce) are so similar and integrated that it is impossible to distinguish between them and their hybrids using morphological characteristics. Although natural hybrids between P. glauca and P. mariana (black spruce) do not generally occur, even though the 2 species are sympatric in North America, a first-generation hybrid, called the Rosendahl spruce, has been reported in the literature. In this study, several inter-simple sequence repeat (ISSR) markers were developed, as were randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers, to certify spruce trees and their hybrids. ISSR fingerprinting was more efficient than RAPD assay; it detected 70% polymorphic DNA markers among the spruce species analyzed, whereas RAPD fingerprinting detected only 53%. Species-diagnostic ISSR and RAPD markers differentiating P. glauca from P. engelmannii and P. mariana were cloned and sequenced. Molecular certification of the spruce samples analyzed confirmed that all the seeds from interior spruce populations were true hybrids of P. glauca and P. engelmannii. But the analysis of seeds derived from the putative Rosendahl spruce indicated that this tree is likely a pure P. glauca genotype, rather than a hybrid of P. glauca and P. mariana. These data were confirmed by cytological analyses. Further analysis, using a more sensitive DNA amplification method with designed primers flanking the species-diagnostic ISSR and RAPD markers, revealed that such sequences are not generally species-specific because they are present in other spruce species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,797
Score d'incertitude au seuil0,216

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2005
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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