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Enregistrement W2084368553 · doi:10.1111/mec.13194

Integrating phylogeography and paleoecology to investigate the origin and dynamics of hybrid zones: insights from two widespread<scp>N</scp>orth<scp>A</scp>merican firs

2015· article· en· W2084368553 sur OpenAlexafffund
Benjamin Cinget, Guillaume de Lafontaine, Sébastien Gérardi, Jean Bousquet

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyGene flowAncient DNAEcologyIntrogressionHybrid zoneEvolutionary biologyPinaceaePhylogeographyAbies balsameaSympatric speciationChloroplast DNAGenetic variationPopulationGenomePhylogeneticsGeneticsGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Secondary contact between closely related taxa routinely occurs during postglacial migrations. After initial contact, the location of hybrid zones may shift geographically or remain spatially stable over time in response to various selective pressures or neutral processes. Studying the extent and direction of introgression using markers having contrasted levels of gene flow can help unravel the historical dynamics of hybrid zones. Thanks to their contrasted maternal and paternal inheritance, resulting in different levels of gene flow for mitochondrial and chloroplast DNA (mtDNA and cpDNA), the Pinaceae stand out as a relevant biological model for this purpose. The objective of the study was to assess whether the hybrid zone between Abies balsamea and Abies lasiocarpa (two largely distributed Pinaceae) has moved or remained stable over time by analysing the distribution of cytoplasmic DNA variation as well as published palaeobotanical data. Interspecific gene flow was higher for cpDNA than mtDNA markers; hence, the geographic distribution of mitotypes was more congruent with species distributions than chlorotypes. This genetic signature was contrary to expectations under a moving hybrid zone scenario, as well as empirical observations in other conifers. Genetic evidence for this rare instance of stable hybrid zone was corroborated by the colonization chronology derived from published fossil data, indicating that the two fir species initially came into contact in the area corresponding to the current sympatric zone 11 kyr ago. While an explanatory analysis suggested the putative influence of various environmental factors on the relative abundance of cytoplasmic genome combinations, further research appears necessary to assess the role of both demographic history and selective factors in driving the dynamics of hybrid zones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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