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Enregistrement W2084389584 · doi:10.1247/csf.10022

Localization of SMAP2 to the TGN and its Function in the Regulation of TGN Protein Transport

2011· article· en· W2084389584 sur OpenAlexaff
Tomo Funaki, Shunsuke Kon, Roger Emanuel Rönn, Yuji Henmi, Yuka Kobayashi, Toshio Watanabe, Keiko Nakayama, Kenji Tanabe, Masanobu Satake

Notice bibliographique

RevueCell Structure and Function · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyVesicular stomatitis virusRabGolgi apparatusEndosomeProtein subcellular localization predictionGTPaseTransport proteinVesicleVesicular transport proteinOrganelleVesicular Transport ProteinsChemistryRegulatorBiologyMembraneBiochemistryVirusVirologyEndoplasmic reticulumGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SMAP2 is an Arf GTPase-activating protein that is located and functions on early endosome membranes. In the present study, the trans-Golgi network (TGN) was verified as an additional site of SMAP2 localization based on its co-localization with various TGN-marker proteins. Mutation of specific stretches of basic amino acid residues abolished the TGN-localization of SMAP2. Over-expression of wild-type SMAP2, but not of the mutated SMAP2, inhibited the transport of vesicular stomatitis virus-G protein from the TGN to the plasma membrane. In contrast, this transport was enhanced in SMAP2 (-/-) cells characterized by increased levels of the activated form of Arf. SMAP2 therefore belongs to an ArfGAP subtype that resides on the TGN and functions as a negative regulator of vesicle budding from the organelle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,405
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,170
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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