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Enregistrement W2084444317 · doi:10.1186/1742-4690-9-s2-p205

T cell immune quiescence as a contributor to resistance to infection among HIV Exposed Seronegative (HESN) commercial sex workers from Nairobi, Kenya

2012· article· en· W2084444317 sur OpenAlexaff
KR Fowke, T. Blake Ball, Joshua Kimani, FA Plummer

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueSex work and related issues
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHuman immunodeficiency virus (HIV)MedicineSex workersCohortImmunologyImmune systemAntibodyEnvironmental healthDemographyInternal medicinePopulationResearch methodology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Participants from the Majengo Commerical Sex Worker Cohort in Nairobi, Kenya have been intensely exposed to HIV for 7-20 years of follow-up, and yet have remained uninfected. Since activated CD4+ T cells are much more susceptible to HIV infection and have been suggested to form the initial focus of mucosal infection, we have conducted a number of studies to characterize the T cell phenotype in the mucosal and systemic compartments of these HIV exposed seronegative women (HESN). Representative sampling (n=~30) of HESN women and a similar sized control group of newly enrolled commercial sex workers were compared. Gene expression analysis, immune phenotyping, and in vitro HIV infection assays were performed on peripheral blood mononuclear cells. Mucosal assessment of the female genital tract (FGT) included proteomic analysis by mass spectrometry, flow cytometry and cytokine/chemokines determinations by bead arrays. Gene expression analysis revealed the HESN women showed reduced gene levels for pathways involved in T cell receptor activation and HIV host dependent factors. Systemic CD4+ T cells showed lower levels of immune activation (CD69) and higher levels of regulatory T cells (T regs). Infection frequency, the number of infected replicate wells, was lower in the HESN women and correlated with ex vivo assessment of reduced T cell activation and elevated T reg levels. Mucosal assessment by proteomics showed higher levels of anti-inflammatory serine proteases and lower levels of the chemokines IP-10 and MIG, which functions are to recruit activated T cells into the mucosal environment. Together, these data suggest that the HESN women of the Majengo Cohort display a T cell Immune Quiescent phenotype that is characterized by fewer activated T cells, more regulatory T cells and a mucosal environment that favours quiescent cells. The result is an environment that is not favorable for the establishment of HIV infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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