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Enregistrement W2084540500 · doi:10.1139/v02-195

From T-antigen to plasmalogen-derived aldehydes: The identification of a marker of colorectal cancer in human rectal mucous

2003· article· en· W2084540500 sur OpenAlexvenueno aff
Jiří J. Křepinský, Gabor Kandel, Ka Sing Yeung, Jacek Chociej, Min Chen, Gideon Cohen, Stephen P. Douglas, Rudolf Furrer, Vishal Kukreti, Niculina Lupescu, Enoka Richens, Keith Tanner

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGalactose oxidaseReagentAldehydeColorectal cancerGalactoseBiochemistryOrganic chemistryCancerCatalysisInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recently, a simple noninvasive screening test for colorectal cancer was proposed, based on a hypothesis involving galactose-containing carbohydrate moieties such as the Thomsen–Friedenreich antigen. According to the hypothesis, such carbohydrate moieties, present in the human rectal mucous of patients with colorectal cancer, can be specifically oxidized with galactose oxidase to form substances that, upon reaction with Schiff reagent, yield purple (magenta) coloured compounds. While evaluating this proposed test, we discovered that the colour formation is not due to the proposed reaction between oxidized galactose moieties present in rectal mucous and Schiff reagent. We found instead that the mucous from colorectal cancer patients contains compounds that form purple (magenta) adducts with the Schiff reagent directly, i.e., they do not require oxidation by galactose oxidase. We have identified these compounds as long-chain aliphatic aldehydes, mainly palmitic aldehyde C15H31CH=O and stearic aldehyde C17H35CH=O. We have further found that the aldehydes originate from plasmalogens present in the phospholipid fraction of the mucous obtained from colorectal cancer patients. The aldehydes, present in plasmalogens as enol ethers, are released by the acidity of the Schiff reagent and in turn react with the Schiff reagent to form the coloured adducts. Correct identification of these markers could lead to the development of a more accurate colorectal cancer screening tool and to a deeper understanding of colorectal carcinogenesis.Key words: T-antigen, plasmalogen-derived aldehydes, colorectal cancer marker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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