Chryseolinea serpens gen. nov., sp. nov., a member of the phylum Bacteroidetes isolated from soil
Notice bibliographique
Résumé
An aerobic chemoheterotrophic gliding bacterium, designated RYG(T), was isolated from a soil in Germany. Cells were Gram-stain-negative, thin rods (0.4-0.6 µm in width and 2.0-5.5 µm in length). Cells multiplied by normal cell division and no resting stages were observed. Colonies were yellow and displayed swarming edges. Gliding motility was observed in wet mounts. Strain RYG(T) grew at pH 5.6-7.7 (optimum pH 6.6-7.0), at 13-37 °C (optimum 25-30 °C) and with 0-1.0 % NaCl (optimum 0-0.1 %). The isolate was incapable of atmospheric nitrogen fixation and grew on most mono- and disaccharides as well as a few polysaccharides and organic acids. The predominant menaquinone was MK-7, the major cellular fatty acids were C(16 : 1)ω5c and iso-C(15 : 0) and the major intact polar lipids were composed of phosphatidylethanolamine derivatives and two unknown series. The DNA G+C content was 49.9 mol%. Based on 16S rRNA gene sequence analysis, the isolate belonged to the phylum Bacteroidetes, class Cytophagia, order Cytophagales, but was only distantly related to any cultured bacteria. The closest relatives were Ohtaekwangia koreensis 3B-2(T) and Ohtaekwangia kribbensis 10AO(T) (both 93 % 16S rRNA gene sequence similarity). We propose a novel genus and species, Chryseolinea serpens gen. nov., sp. nov.. Strain RYG(T) ( = DSM 24574(T) = ATCC BAA-2075(T)) is the type strain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».