PHYLOGENY OF THE DUMONTIACEAE (GIGARTINALES, RHODOPHYTA) AND ASSOCIATED FAMILIES BASED ON SSU rDNA AND INTERNAL TRANSCRIBED SPACER SEQUENCE DATA
Notice bibliographique
Résumé
Small subunit (SSU) rDNA was sequenced for 25 species in 19 genera of the Gigartinales (Rhodophyta). As well, the internal transcribed spacer (ITS) region was sequenced, and a data matrix of 36 morphological characters was constructed for 16 species of Dumontiaceae. Phylogenetic trees were calculated from a multiple alignment of the SSU sequence data to infer relationships between species of Dumontiaceae and other gigartinalean taxa. The SSU analysis produced a polyphyletic Dumontiaceae. Notably, Acrosymphyton failed to associate with the included Gigartinales, let alone the Dumontiaceae, supporting an earlier proposal to remove it to a new family. The analyses were equivocal about the phylogenetic affinities of Dudresnaya, which clustered with the Kallymeniaceae, and the affinities of the Indo‐West Pacific Gibsmithia, Kraftia, and Dasyphloea, the last‐mentioned clustering with the Antarctic Gainiaceae, and these four taxa with Portieria (Rhizophyllidaceae). Further investigations are necessary to resolve relationships among these taxa. Rhodopeltis, a genus recently moved to the Dumontiaceae from the Polyideaceae, showed a weak association with the remaining northern Dumontiaceae. The final group consisted of cold‐temperate Northern Hemisphere species. Phylogenetic analyses using a combination of SSU, ITS, and morphological data within this clade produced two strongly supported clades, a Dilsea/Neodilsea clade and a Cryptosiphonia/Dumontia clade. Dilsea is derived from a paraphyletic Neodilsea and may itself be polyphyletic. Atlantic and Pacific isolates of Dumontia contorta clearly showed sufficient divergence to warrant recognition as distinct species, and Dumontia alaskana, sp. nov. is proposed for the Pacific species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».