Low proportion of whole exon deletions causing phenylketonuria in Denmark and Germany
Notice bibliographique
Résumé
Phenylketonuria (PKU) is an autosomal recessive genetic disorder caused by mutations of the gene encoding phenylalanine hydroxylase (PAH). More than 500 different PAH mutations have been identified and about 90% of these are single base mutations. Although the identification rate of the PAH mutations is generally very high, some variants remain unidentified. A fraction of these mutations are the result of genomic deletions or duplications, which are not recognized with standard PCR-based methods. Here we present the results of exon deletion or duplication analysis in a total of 34 families, in which two mutations had not been identified using conventional diagnostic screening techniques. Using multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA), we found a deletion covering exon 1 and exon 2 (c.1-?_168+?del) in one patient, a deletion of exon 3 (c.169-?_352+?del) in four patients, and a deletion of exon 5 (c.442-?_509+?del) in two patients. A deletion was thus detected in about 20% (7/34) of the families tested. Out of a combined cohort of 570 independent PKU patients from Denmark and Germany, exon deletions were identified in a total of four patients. The estimated allelic frequency of exon deletions in PKU patients in these two populations is therefore below 0.5%.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».