Phylogeny of members of the rockfish (<i>Sebastes</i>) subgenus<i>Pteropodus</i>and their relatives
Notice bibliographique
Résumé
The Sebastes Cuvier, 1829 subgenus Pteropodus Eigenmann and Beeson, 1893 includes six species from the northeastern Pacific Ocean (NEP) and four species from the northwestern Pacific Ocean (NWP). Several NEP species assigned to other subgenera are similar to NEP Pteropodus species. Restriction site variation in the mitochondrial NADH dehydrogenase subunit 3 and 4 genes and the 12S and 16S ribosomal RNA genes were used to evaluate their relationships. Phylogenetic reconstruction showed that six NEP species of Pteropodus formed a monophyletic group that also included three NEP species currently assigned to other subgenera: Sebastes atrovirens (Jordan and Gilbert, 1880) (subgenus Mebarus Matsubara, 1943) and Sebastes auriculatus Girard, 1854 and Sebastes dalli (Eigenmann and Beeson, 1894) (both subgenus Auctospina (Eigenmann and Beeson, 1894)). The small average nucleotide divergence (0.0124 per nucleotide) observed among members of this group of species was similar to that observed among species of the monophyletic subgenus Sebastomus Gill, 1864 (0.0089 per nucleotide). The NWP species of Pteropodus did not cluster with their NEP consubgeners but, generally, were similar to other NWP species. We recommend that S. atrovirens, S. auriculatus, and S. dalli be included in subgenus Pteropodus with the other NEP species and that the NWP species of Pteropodus be removed from the subgenus. Our results indicate that the morphological characteristics used to distinguish species often may not be useful for phylogenetic analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».