Abstract LB-204: Gene expression profiling of hormone-regulating pathways in tumoral and peritumoral breast tissues
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: The purpose of our investigation was to study the mRNA expression of sex-steroids pathways involved in androgen and estrogen synthesis and metabolism in tumor and surrounding peritumoral normal breast tissues. High integrity RNA was purified and specific quantitative realtime PCR assays was performed to assess expression level of thirty two genes in breast tissues from the 4 quadrants of postmenopausal mastectomy patients diagnose with breast cancer. The expression changes between tumors (n=31) and paired normal (n=86) tissues were assessed using a general linear model on log-transformed data. Results: The main pathway involved in estrogen synthesis in postmenopausal women, steroid sulfatase, was detected at lower levels in tumor tissues compared to non-malignant tissues. mRNA expression levels of aromatase converting androgen to estrogen were relatively constant between peritumoral normal and tumoral tissues while androgen conjugating enzymes leading to inactive metabolites were overexpressed in tumoral tissues (1.4-fold; P < 0.04). Expression of CYP1A1, involved in the synthesis of 2-hydroxy-catecholestrogens, was constantly detected at lower level in tumors compared to peritumoral tissues (3.7 fold; P < 0.001). However, no prominent changes for the catechol-o-methytransferase (COMT), involved in the conversion of 2-hydroxy-catecholestrogens to methoxy metabolites with cancer-protective properties, was noted. In contrast, CYP1B1 expression was enhanced by 1.7 fold in tumors (P < 0.001) suggesting a greater in situ formation of 4-hydroxy-catecholestrogens, a group of metabolites associated with DNA damage and production of redox species. Data also reveal a lower expression in tumors of the NAD(P)H quinone oxydoreductase 2 (NQO2) most active against catechol estrogens (1.8-fold; P=0.04), while expression of NQO1 remained unchanged. These observations were further enhanced in estrogen receptor positive tumors. Conclusion: Our data add to the emerging evidence of an imbalance in the production of androgen, estrogen and their metabolites in breast tumors, preferentially leading to the accumulation of carcinogenic metabolites while decreasing protective metabolites in neoplastic tissue compared to normal tissue. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr LB-204.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».