Plant glutathione transferases — a decade falls short
Notice bibliographique
Résumé
The glutathione transferase (GST) superfamily in plants has been subdivided into eight classes, seven of which (phi, tau, zeta, theta, lambda, dehydroascorbate reductase, and tetrachlorohydroquinone dehalogenase) are soluble and one is microsomal. Since their identification in plants in 1970, these enzymes have been well established as phase II detoxification enzymes that perform several other essential functions in plant growth and development. These enzymes catalyze nucleophilic conjugation of the reduced form of the tripeptide glutathione to a wide variety of hydrophobic, electrophilic, and usually cytotoxic substrates. In plants, the conjugated product is either sequestered in the vacuole or transferred to the apoplast. The GSTs of phi and tau classes, which are plant-specific and the most abundant, are chiefly involved in xenobiotic metabolism. Zeta- and theta-class GSTs have very restricted activities towards xenobiotics. Theta-class GSTs are glutathione peroxidases and are involved in oxidative-stress metabolism, whereas zeta-class GSTs act as glutathione-dependent isomerases and catalyze the glutathione-dependent conversion of maleylacetoacetate to fumarylacetoacetate. Zeta-class GSTs participate in tyrosine catabolism. Dehydroascorbate reductase- and lambda-class GSTs function as thioltransferases. Microsomal-class GSTs are members of the MAPEG (membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism) superfamily. A plethora of studies utilizing both proteomics and genomics approaches have greatly helped in revealing the functional diversity exhibited by these enzymes. The three-dimensional structure of some of the members of the family has been described and this has helped in elucidating the mechanism of action and active-site amino-acid residues of these enzymes. Although a large amount of information is available on this complex enzyme superfamily, more research is necessary to answer additional questions such as, why are phi- and tau-class GSTs more abundant than GSTs from other classes? What functions do phi- and tau-class GSTs perform in plant taxa other than angiosperms? Do more GST classes exist? Future studies on GSTs should focus on these aspects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,009 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».