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Enregistrement W2084954199 · doi:10.1099/ijs.0.029033-0

Enterococcus ureasiticus sp. nov. and Enterococcus quebecensis sp. nov., isolated from water

2011· article· en· W2084954199 sur OpenAlexafffund
Viridiana Sistek, Andrée F. Maheux, Maurice Boissinot, Kathryn Bernard, Philippe Cantin, Ilse Cleenwerck, Paul de Vos, Michel G. Bergeron

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensHealth CanadaUniversité LavalUniversity of ManitobaCentre hospitalier de l'Université Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChulalongkorn University
Mots-clésBiology16S ribosomal RNAHousekeeping geneEnterococcusPhylogenetic treeMicrobiologyEnterococcus faecalisGeneGeneticsBacteriaEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three enterococcal isolates, CCRI-16620, CCRI-16986(T) and CCRI-16985(T), originating from water were characterized using morphological, biochemical and molecular taxonomic methods. 16S rRNA gene sequence analysis classified all three strains in the Enterococcus faecalis species group. The phylogenetic tree of 16S rRNA gene sequences showed that the three isolates form two separate branches. The first branch is represented by strains CCRI-16620 and CCRI-16986(T) and the second branch by strain CCRI-16985(T). Further sequence analysis of the housekeeping genes rpoA (encoding RNA polymerase α subunit), pheS (phenylalanyl-tRNA synthase), tufA (elongation factor Tu) and atpD (ATP synthase β-subunit) as well as the results of amplified fragment length polymorphism (AFLP) DNA fingerprinting and DNA-DNA hybridization experiments confirmed the distinct status of these strains. Moreover, biochemical tests allowed phenotypic differentiation of the strains from the other species of the E. faecalis species group. On the basis of the results obtained, the names Enterococcus ureasiticus sp. nov. (type strain CCRI-16986(T) = CCUG 59304(T) = DSM 23328(T) = LMG 26304(T)) and Enterococcus quebecensis sp. nov. (type strain CCRI-16985(T) = CCUG 59306(T) = DSM 23327(T) = LMG 26306(T)) are proposed for the two hitherto undescribed species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,555
Score d'incertitude au seuil0,583

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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