CTLA4 promoter polymorphisms are associated with canine diabetes mellitus
Notice bibliographique
Résumé
Canine diabetes mellitus (DM) shares many similarities with human type 1 diabetes (T1D). It is a complex genetic disorder, which shows marked differences in breed susceptibility, with Samoyed dogs being highly susceptible, whereas the Boxer breed is relatively resistant. A number of immune response genes, which have been associated with human T1D, have also been implicated in determining susceptibility to canine DM, suggesting an immune-mediated component to the disease pathogenesis. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the CTLA4 gene have consistently and reproducibly been associated with human T1D and other autoimmune diseases but the canine CTLA4 gene has not previously been investigated for involvement in canine DM. SNPs of particular interest in the human association studies are those in the promoter region which affect CTLA4 expression levels, and that of exon 1 which results in a non-synonymous amino acid change. We performed a canine SNP discovery investigation of CTLA4 on a region of DNA containing exon 1 and 1.5 kb upstream sequence in order to identify promoter region SNPs. Confirmed SNPs were used in a genetic association study of a canine diabetic cohort showing that CTLA4 promoter polymorphisms were associated with diabetes in crossbreed dogs and in five Pedigree breeds-Samoyed, Miniature Schnauzer, West Highland White Terrier, Border Terrier and Labrador. Meta-analysis of these breeds showed 9 out of 15 SNPs were associated with DM and genotype and haplotype analyses also confirmed the allelic associations in these breeds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».