Relationships among isolates of <i>Botrytis cinerea</i> collected from greenhouses and field locations in Alberta, based on RAPD analysis
Notice bibliographique
Résumé
This study was undertaken to determine whether there was genetic diversity among isolates of Botrytis cinerea (teleomorph Botryotinia fuckeliana) collected from greenhouses and field locations in Alberta, Canada, and whether genetic diversity could be attributed to collection location and (or) host plant species. The study was conducted to provide basic information that is intended for use in developing effective greenhouse control strategies for B. cinerea. Ninety-one isolates of B. cinerea were collected from 20 host plant species in 31 greenhouse and field locations across the province. Relationships among subsets of the isolates were assessed, using random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis, and correlated with collection location and host plant. The first subset comprised 38 isolates collected from tomato (Lycopersicon esculentum) in eight greenhouses. The second subset was made up of 50 isolates from 10 host species collected in 10 greenhouses. The third subset consisted of 35 isolates from 17 host species from 23 greenhouses and 8 field locations. Random amplified polymorphic DNA analysis demonstrated distinct groups of B. cinerea within greenhouses in Alberta. Isolates in the three subsets clustered together based on the greenhouse of origin, but not on geographic region or host species. To our knowledge this is the first report of specialization in B. cinerea based on the greenhouse of origin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».