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Enregistrement W2085007840 · doi:10.1080/07060660609507277

Relationships among isolates of <i>Botrytis cinerea</i> collected from greenhouses and field locations in Alberta, based on RAPD analysis

2006· article· en· W2085007840 sur OpenAlexafffundvenueabout
James. Calpas, Michele Konschuh, C. C. Toews, J. P. Tewari

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFungal Plant Pathogen Control
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAgriculture Food and Rural Development
Organismes subventionnairesUniversity of Alberta
Mots-clésGreenhouseRAPDBiologyBotrytis cinereaHost (biology)Genetic diversityLycopersiconBotanyHorticultureEcologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study was undertaken to determine whether there was genetic diversity among isolates of Botrytis cinerea (teleomorph Botryotinia fuckeliana) collected from greenhouses and field locations in Alberta, Canada, and whether genetic diversity could be attributed to collection location and (or) host plant species. The study was conducted to provide basic information that is intended for use in developing effective greenhouse control strategies for B. cinerea. Ninety-one isolates of B. cinerea were collected from 20 host plant species in 31 greenhouse and field locations across the province. Relationships among subsets of the isolates were assessed, using random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis, and correlated with collection location and host plant. The first subset comprised 38 isolates collected from tomato (Lycopersicon esculentum) in eight greenhouses. The second subset was made up of 50 isolates from 10 host species collected in 10 greenhouses. The third subset consisted of 35 isolates from 17 host species from 23 greenhouses and 8 field locations. Random amplified polymorphic DNA analysis demonstrated distinct groups of B. cinerea within greenhouses in Alberta. Isolates in the three subsets clustered together based on the greenhouse of origin, but not on geographic region or host species. To our knowledge this is the first report of specialization in B. cinerea based on the greenhouse of origin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,482
Score d'incertitude au seuil0,970

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,164
Écart entre enseignants0,154 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2006
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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