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Enregistrement W2085068613 · doi:10.1111/j.1745-4581.2008.00149.x

DEVELOPMENT OF A MULTIWELL ANTAGONISTIC ACTIVITY ASSAY FOR THE DETECTION OF BACTERIOCIN PRODUCTION BY LACTIC ACID BACTERIA

2009· article· en· W2085068613 sur OpenAlexfundno aff
Kaoutar Yaakoubi, Noreddine Benkerroum, Florent Wiorowski, Françoise Sanson, Julien Haydersah, Isabelle Chevallier

Notice bibliographique

RevueJournal of Rapid Methods & Automation in Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgence Universitaire de la Francophonie
Mots-clésBacteriocinBacteriaLactic acidAntimicrobialMicrobiologyListeria monocytogenesBiologyEscherichia coliChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT A total of 300 strains of lactic acid bacteria (LAB) were screened for the production of bacteriocins active against Listeria innocua or Escherichia coli by using two different techniques: the conventional well‐diffusion assay and a newly developed one based on turbidity measurement of the growth of an indicator bacterium in the neutralized cell‐free supernatant of the putative bacteriocin‐producing strain. The latter technique, designated as the multiwell antagonistic activity assay (MW3A), offers advantages over the previously known methods. Notably, it allows testing simultaneously a large number of LAB for the production of bacteriocins against more than one indicator strain, while including appropriate controls for confirmation of the bacteriocinogenic nature of the inhibitory substances. Furthermore, five enterococcal strains were shown to produce bacteriocins active against the gram‐positive and gram‐negative indicator strains used in this study, suggesting that these enterococci or their bacteriocins have good potential to enhance food safety and keeping quality. PRACTICAL APPLICATIONS The present study describes a rapid and semiautomatic nephelometry method to screen for bacteriocin‐producing lactic acid bacteria (LAB). The method uses a microtiter plate where the inhibition of the growth of indicator strains in the presence of a bacteriocin is revealed by a decrease in OD as function of time. Concomitantly, this method determines the proteinaceous nature of the antimicrobial substance and its mode of action (i.e., bactericidal or bacteriostatic) while excluding the effect of interfering antimicrobials produced by LAB (e.g., hydrogen peroxide and organic acids). Furthermore, the newly described method differs from previously described ones by its ability to test for a relatively large number of putative bacteriocin‐producing strains using different controls and indicator strains, and allow early detection of bacteriocin‐producing strains (within 24 h). Another feature of this method is its ability to detect with confidence bacteriocins active against gram‐negative bacteria. These performances have potential to be used for rapid detection of LAB having strong capacity to inhibit pathogenic or spoilage bacteria by means of bacteriocins for possible applications in food preservation strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,404
Score d'incertitude au seuil0,172

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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