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Enregistrement W2085191605 · doi:10.1074/jbc.275.16.11778

Mutation of Divergent Region 1 Alters Caffeine and Ca2+ Sensitivity of the Skeletal Muscle Ca2+Release Channel (Ryanodine Receptor)

2000· article· en· W2085191605 sur OpenAlexafffund
Guo Guang Du, Vijay K. Khanna, David H. MacLennan

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council Canada
Mots-clésRyanodine receptorAmino acidChemistryCaffeineMutantBiochemistryBiophysicsReceptorBiologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Replacement of amino acids 4187-4628 in the skeletal muscle Ca(2+) release channel (skeletal ryanodine receptor (RyR1)), including nearly all of divergent region 1 (amino acids 4254-4631), with the corresponding cardiac ryanodine receptor (RyR2) sequence leads to increased sensitivity of channel activation by caffeine and Ca(2+) and to decreased sensitivity of channel inactivation by elevated Ca(2+) (Du, G. G., and MacLennan, D. H. (1999) J. Biol. Chem. 274, 26120-26126). In further investigations, this region was subdivided by the construction of new chimeras, and alterations in channel function were detected by measurement of the caffeine dependence of in vivo Ca(2+) release and the Ca(2+) dependence of [(3)H]ryanodine binding. Chimera RF10a (amino acids 4187-4381) had a lower EC(50) value for activation by caffeine, and RF10c (4557-4628) had a higher EC(50) value, whereas the EC(50) value for chimera RF10b (4382-4556) was unchanged. Chimeras RF10b and RF10c were more sensitive to activation by Ca(2+), whereas RF10a was less sensitive to inactivation by Ca(2+), implicating RF10b and RF10c in Ca(2+) activation and RF10a in Ca(2+) inactivation. Deletion of much of divergent region 1 sequence to create mutant Delta4274-4535 led to higher caffeine and Ca(2+) sensitivity of channel activation and to lower Ca(2+) sensitivity for inactivation. Thus, deletion results demonstrate that caffeine, Ca(2+), and ryanodine binding sites are not located in amino acids 4274-4535. Nevertheless, the properties of the deletion and chimeric mutants demonstrate that amino acids 4274-4535 and three shorter sequences in this region (F10a, amino acids 4187-4381; F10b, 4382-4556; and F10c, 4557-4628) in RyR1 modulate Ca(2+) and caffeine sensitivity of the Ca(2+) release channel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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