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Enregistrement W2085191605 · doi:10.1074/jbc.275.16.11778

Mutation of Divergent Region 1 Alters Caffeine and Ca2+ Sensitivity of the Skeletal Muscle Ca2+Release Channel (Ryanodine Receptor)

2000· article· en· W2085191605 sur OpenAlexafffund
Guo Guang Du, Vijay K. Khanna, David H. MacLennan

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council Canada
Mots-clésRyanodine receptorAmino acidChemistryCaffeineMutantBiochemistryBiophysicsReceptorBiologyEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Replacement of amino acids 4187-4628 in the skeletal muscle Ca(2+) release channel (skeletal ryanodine receptor (RyR1)), including nearly all of divergent region 1 (amino acids 4254-4631), with the corresponding cardiac ryanodine receptor (RyR2) sequence leads to increased sensitivity of channel activation by caffeine and Ca(2+) and to decreased sensitivity of channel inactivation by elevated Ca(2+) (Du, G. G., and MacLennan, D. H. (1999) J. Biol. Chem. 274, 26120-26126). In further investigations, this region was subdivided by the construction of new chimeras, and alterations in channel function were detected by measurement of the caffeine dependence of in vivo Ca(2+) release and the Ca(2+) dependence of [(3)H]ryanodine binding. Chimera RF10a (amino acids 4187-4381) had a lower EC(50) value for activation by caffeine, and RF10c (4557-4628) had a higher EC(50) value, whereas the EC(50) value for chimera RF10b (4382-4556) was unchanged. Chimeras RF10b and RF10c were more sensitive to activation by Ca(2+), whereas RF10a was less sensitive to inactivation by Ca(2+), implicating RF10b and RF10c in Ca(2+) activation and RF10a in Ca(2+) inactivation. Deletion of much of divergent region 1 sequence to create mutant Delta4274-4535 led to higher caffeine and Ca(2+) sensitivity of channel activation and to lower Ca(2+) sensitivity for inactivation. Thus, deletion results demonstrate that caffeine, Ca(2+), and ryanodine binding sites are not located in amino acids 4274-4535. Nevertheless, the properties of the deletion and chimeric mutants demonstrate that amino acids 4274-4535 and three shorter sequences in this region (F10a, amino acids 4187-4381; F10b, 4382-4556; and F10c, 4557-4628) in RyR1 modulate Ca(2+) and caffeine sensitivity of the Ca(2+) release channel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,264

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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