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Enregistrement W2085245980 · doi:10.1371/journal.pone.0043998

Staphylococcus aureus Methicillin-Resistance Factor fmtA Is Regulated by the Global Regulator SarA

2012· article· en· W2085245980 sur OpenAlexafffund
Yinglu Zhao, Vidhu Verma, A. Belcheva, Atul K. Singh, Michael D. Fridman, Dasantila Golemi‐Kotra

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésOperonTranscription factorBiologyPenicillin binding proteinsPromoterTranscription (linguistics)MutantRegulation of gene expressionRegulatorTranscriptional regulationStaphylococcus aureusMolecular biologyGene expressionGeneMicrobiologyGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

fmtA encodes a low-affinity penicillin binding protein in Staphylococcus aureus. It is part of the core cell wall stimulon and is involved in methicillin resistance in S. aureus. Here, we report that the transcription factor, SarA, a pleiotropic regulator of virulence genes in S. aureus, regulates the expression of fmtA. In vitro binding studies with purified SarA revealed that it binds to specific sites within the 541-bp promoter region of fmtA. Mutation of a key residue of the regulatory activity of SarA (Arg90) abolished binding of SarA to the fmtA promoter, suggesting that SarA binds specifically to the fmtA promoter region. In vivo analysis of the fmtA promoter using a lux operon reporter fusion show high level expression following oxacillin induction, which was abrogated in a sarA mutant strain. These data suggest that SarA is essential for the induction of fmtA expression by cell wall-specific antibiotics. Further, in vitro transcription studies show that SarA enhances fmtA transcription and suggest that regulation of fmtA could be via a SigA-dependent mechanism. Overall, our results show that SarA plays a direct role in the regulation of fmtA expression via binding to the fmtA promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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