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Enregistrement W2085312025 · doi:10.1074/jbc.m110.176305

N-cadherin and Neuroligins Cooperate to Regulate Synapse Formation in Hippocampal Cultures

2010· article· en· W2085312025 sur OpenAlexaff
Mytyl Aiga, Joshua N. Levinson, Shernaz X. Bamji

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCadherinGene knockdownSynapseBiologyHippocampal formationExcitatory synapseGlutamatergicSynaptogenesisSilent synapseCell biologyNeuroscienceExcitatory postsynaptic potentialGlutamate receptorCellCell cultureBiochemistryGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cadherins and neuroligins (NLs) represent two families of cell adhesion proteins that are essential for the establishment of synaptic connections in vitro; however, it remains unclear whether these proteins act in concert to regulate synapse density. Using a combination of overexpression and knockdown analyses in primary hippocampal neurons, we demonstrate that NL1 and N-cadherin promote the formation of glutamatergic synapses through a common functional pathway. Analysis of the spatial relationship between N-cadherin and NL1 indicates that in 14-day in vitro cultures, almost half of glutamatergic synapses are associated with both proteins, whereas only a subset of these synapses are associated with N-cadherin or NL1 alone. This suggests that NL1 and N-cadherin are spatially distributed in a manner that enables cooperation at synapses. In young cultures, N-cadherin clustering and its association with synaptic markers precede the clustering of NL1. Overexpression of N-cadherin at this time point enhances NL1 clustering and increases synapse density. Although N-cadherin is not sufficient to enhance NL1 clustering and synapse density in more mature cultures, knockdown of N-cadherin at later time points significantly attenuates the density of NL1 clusters and synapses. N-cadherin overexpression can partially rescue synapse loss in NL1 knockdown cells, possibly due to the ability of N-cadherin to recruit NL2 to glutamatergic synapses in these cells. We demonstrate that cadherins and NLs can act in concert to regulate synapse formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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