Dephosphorylation of the nuclear factor of activated T cells (NFAT) transcription factor is regulated by an RNA-protein scaffold complex
Notice bibliographique
Résumé
Nuclear factor of activated T cells (NFAT) proteins are Ca(2+)-regulated transcription factors that control gene expression in many cell types. NFAT proteins are heavily phosphorylated and reside in the cytoplasm of resting cells; when cells are stimulated by a rise in intracellular Ca(2+), NFAT proteins are dephosphorylated by the Ca(2+)/calmodulin-dependent phosphatase calcineurin and translocate to the nucleus to activate target gene expression. Here we show that phosphorylated NFAT1 is present in a large cytoplasmic RNA-protein scaffold complex that contains a long intergenic noncoding RNA (lincRNA), NRON [noncoding (RNA) repressor of NFAT]; a scaffold protein, IQ motif containing GTPase activating protein (IQGAP); and three NFAT kinases, casein kinase 1, glycogen synthase kinase 3, and dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase. Combined knockdown of NRON and IQGAP1 increased NFAT dephosphorylation and nuclear import exclusively after stimulation, without affecting the rate of NFAT rephosphorylation and nuclear export; and both NRON-depleted T cells and T cells from IQGAP1-deficient mice showed increased production of NFAT-dependent cytokines. Our results provide evidence that a complex of lincRNA and protein forms a scaffold for a latent transcription factor and its regulatory kinases, and support an emerging consensus that lincRNAs that bind transcriptional regulators have a similar scaffold function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».