Phylogeny of cyclic nitramine-degrading psychrophilic bacteria in marine sediment and their potential role in the natural attenuation of explosives
Notice bibliographique
Résumé
Previously we reported on in situ mineralization of cyclic nitramine explosives including hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine (RDX) and octahydro-1,3,5,7-tetranitro-1,3,5,7-tetrazocine (HMX) in marine sediment from Halifax Harbour. In the present study, we isolated several novel psychrophilic bacteria from the sediment with optimal growth temperature at 10 or 15 degrees C. Phylogenetic analysis of their 16S rRNA genes identified the isolates as members of the gamma and delta subdivisions of Proteobacteria, Fusobacteria and Clostridiales. The isolates mineralized 3.7-45.2% of RDX (92 microM) in 82 days of incubation at 10 degrees C under oxygen-limited or anaerobic conditions with the gamma subdivision isolates demonstrating the highest mineralization (45.2% of total C). Removal of RDX by all isolates was accompanied by the formation of all three nitroso derivatives, with the mono nitroso derivative (MNX) being the major one. Isolates of the delta proteobacteria and Fusobacteria removed HMX with concurrent formation of the mononitroso derivative (NO-HMX). Using resting cells of isolates of the gamma subdivision, methylenedinitramine (MEDINA) and 4-nitro-2,4-diazabutanal (NDAB) were detected, suggesting ring-cleavage following denitration of either RDX and/or its initially reduced product, MNX. These results clearly demonstrate that psychrophilic bacteria capable of degrading cyclic nitramines are present in the marine sediment, and might contribute to the in situ biodegradation and natural attenuation of the chemicals.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».